![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
jayrandomОдна из "внутренних" поговорок в нашей семье родилась, когда был запущен первый искусственный спутник Земли. Моя мама, как и весь советский народ, весьма гордилась за свою страну и её успехи в освоении космоса. Однако мой прадед Иван был не таков. "Да, Люсенька," - сказал он ей задумчиво, - "свет науки угас...". Мама пыталась выяснить, почему же угас - ведь, казалось бы, наоборот - столь высокий уровень технологии напрямую говорит и о высочайших успехах в науке. Но прадед, неопределённо отмахнувшись, остался при своём мнении: угас.
Сегодня, сидя на институтском семинаре, я с ним согласился. Обсуждался пятилетний план по мышам на период финансирования 2006-2011 (да, у нас тоже есть пятилетки). Мега-проект состоит в том, чтобы по-отдельности провести нокаут (прицельное выведение из строя) каждого мышиного гена (их десятки тысяч) и по возможности, если такой нокаут не является летальным, - вывести линию соответствующих мутантов.
Если представить себе масштаб работ и требуемый уровень технологии, то шапка падает назад, а челюсть вперёд. Неизвестно ещё, что круче - полёты в космос или такая вот способность по модифицированию живых организмов. Но если вспомнить, что такой варварский метод изучения требуется потому, что мы не понимаем, как устроена жизнь и пытаемся в этом разобраться методом ковровой бомбардировки, то шерсть становится дыбом.
Сегодня, сидя на институтском семинаре, я с ним согласился. Обсуждался пятилетний план по мышам на период финансирования 2006-2011 (да, у нас тоже есть пятилетки). Мега-проект состоит в том, чтобы по-отдельности провести нокаут (прицельное выведение из строя) каждого мышиного гена (их десятки тысяч) и по возможности, если такой нокаут не является летальным, - вывести линию соответствующих мутантов.
Если представить себе масштаб работ и требуемый уровень технологии, то шапка падает назад, а челюсть вперёд. Неизвестно ещё, что круче - полёты в космос или такая вот способность по модифицированию живых организмов. Но если вспомнить, что такой варварский метод изучения требуется потому, что мы не понимаем, как устроена жизнь и пытаемся в этом разобраться методом ковровой бомбардировки, то шерсть становится дыбом.
С чего мы начнём [починку радиоприёмника - прим.jayrandom] ? Сначала мы заручимся финансовой поддержкой, чтобы купить большое количество одинаковых работающих приёмников и сравнить их с тем, который сломан. После нескольких попыток мы научимся вскрывать приёмники и найдем там объекты разной формы, размера и цвета (рис. 2). Мы опишем и классифицируем их в семейства на основе их внешнего вида. Мы опишем семейство металлических прямоугольных объектов, семейство ярких круглых объектов с двумя ножками, семейство цилиндрических объектов с тремя ножками и так далее. Так как объекты окрашены в разные цвета, мы будем изучать влияние смены цвета на качество звука. Хотя перекраска объектов будет иметь слабый эффект (музыка слышна, но тренированное ухо некоторых исследователей заметит некоторые искажения), этот подход произведет много публикаций и приведет к оживленным дискуссиям.
Более успешным подходом станет экстрагирование компонентов приёмника, либо выборочно по одному, либо расстреливая работающие приёмники с близкого расстояния дробью. В последнем случае, расстрелянные приёмники, которые прекратили работать (приёмники с фенотипом), используются, чтобы опознать компонент, разрушение которого привело к фенотипу.
Хотя удаление некоторых компонентов будет иметь минимальный эффект, удачливый молодой исследователь случайно найдет проводок, чье отсутствие приведёт к полному прекращению музыки. Торжествующий исследователь назовет этот проводок Случайно Открытый Компонент (СОК) и затем выяснит, что СОК необходим как связь между длинным выдвигаемым объектом и остальными частями приёмника. Этот объект будет конечно назван Самый Важный Компонент (СВК). Ряд работ установит, что СВК должен быть сделан из металла и что качество звука прямо пропорционально длине СВК, что даст эволюционное обяснение тому, что СВК может выдвигаться.
Радость, вызванная этим открытием, однако, будет прервана настойчивым аспирантом из другой лаборатории, который найдёт ещё один объект, который необходим для работы приемника. К радости открывателя, и к недоумению видных ученых, успешно изучающих СВК, новый объект будет сделан из графита и его длина не будет значительно влиять на качество звука. Более того, аспирант докажет, что СВК не нужен для работы приёмника и, соответственно, назовёт открытый им предмет Действительно Важный Компонент (ДВК). Горячие дискуссии о том, что важнее, СВК или ДВК, будут дополнительно подогреты наблюдением, что одни прёмники требуют СВК, тогда как другие, с виду идентичные, ДВК. Борьба двух школ, поклонников СВК и приверженцев ДВК, будет продолжаться, пока один умный молодой человек не откроет переключатель, чьё положение определяет, какой компонент приёмник использует, СВК или ДВК. Естественно, что переключатель будет назван Безусловно Самый Важный Компонент (БСВК).
(дальше - больше.
-- Юрий Лацебник, "Может ли биолог починить радиоприёмник, или или что я понял, изучая апоптоз".
Английский оригинал статьи: Yuri Lazebnik, "Can a Biologist Fix a Radio? -- or, What I Learned while Studying Apoptosis".
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2006-05-16 01:09 pm (UTC)Люди - варвары.
no subject
Date: 2006-05-16 02:34 pm (UTC)План по мышам звучит так, как будто у вас избыточное финансирование.
no subject
Date: 2006-05-16 02:49 pm (UTC)А с финансированием этого проекта действительно проблем, вроде, нет. В Сангере же самый большой в Европе "мышиный дом" с крематорием недавно построили. Вот, будут заселять.
no subject
Date: 2006-05-16 02:49 pm (UTC)Так значит, вас интересуют мыши, как их чинить и где приобрести?
no subject
Date: 2006-05-16 04:13 pm (UTC)Интересует, как они устроены, очень (предполагается, что это очень много нам расскажет об устройстве человека).
Но методы для выяснения этого устройства сам видишь какие. Вывинтить по-отдельности каждый винтик и посмотреть, как это отразится. Потом, очевидно, придётся вывинчивать по два винтика, по три, и так далее - до 2^n.
no subject
Date: 2006-05-16 04:49 pm (UTC)ИМХО, несложно, как автор, агитировать за повсеместные полеты в космос и освоение Луны, куда сложнее сделать нечто, что даст реальную возможность. Ну, хорошо, допустим, метод вырезания и замены компонентов - сосет. Но тогда какие _конкретно_ методы рулят? Ну, ты ж сам всяко понимаешь, что как пища для думалки нужны экспериментальные данные. Так вот: какие такие экспериментальные методы сейчас существуют, чтобы радикально перейти к этому "формальному подходу", что пропагандирует автор?
(вопрос НЕ риторический. Если известны такие методы, но не используются/мало используются, значит - автор прав. Если таких методов неизвестно, то... Опаньки.)
Послушай еще одну прикольную историю про радиоприемник. :)
Одному нобельщику-физику-ядерщику (главе кооперации из 2000 человек, экспериментально открывших W-бозон) на пресс-конференции задали вопрос: мол, чем вы там все занимаетесь, зачем вас так много и почему все это так сложно и дорого?
Ответ был примерно такой: "попробуйте изучить устройство радиоприемника (то самое слово, да-да :) - прим. alx) и обнаружить там транзисторы, сталкивая эти приемники на огромной скорости и изучая траектории разлета обломков". :)
Но это всё еще не значит, что ядерщики - мазохисты.
no subject
Date: 2006-05-16 08:08 pm (UTC)То есть именно качество думалок должно становиться во главу. Тогда, скорее всего, не потребуется такого количества экспериментов с настолько низким отношением КПД к количеству загробленных живых организмов.
no subject
Date: 2006-05-16 09:22 pm (UTC)Вообще это, конечно, предмет долгого разговора, но: как бы ты сам изучал прогу огромного объема, написаную на языке, в котором тебе лишь частично понятен синтаксис?
Конечно, я с тобой _в чем-то_ тоже согласен: вряд ли нужно ТАКОЕ количество ТАКОЙ сырой инфы (есть проблема в планировании эксперимента), но это уже немножко другое - это не проблема самой науки, а где-то на пересечении управления и экономики. Ну, издержки слишком высокого уровня абстрагирования у тех, кто рулит большими ресурсами. Отвлечемся от конкретики, тксзть. ;)
Причем тут наука-то?
Кстати говоря, насчет физиков я тебе не просто так привел пример, а с намеком. То, чему ты так ужасаешься, уже проходили в 60-е-70-е в ядерной физике. ИМХО, проблема не в биологии и биологах как таковых.
no subject
Date: 2006-05-16 06:15 pm (UTC)А спутник-то был не про наукую Он был демонстрацией всем-всем того факта, что вместо него могла бы лететь и ядерная боеголовка.
no subject
Date: 2006-05-16 07:14 pm (UTC)Можно даже поставить программу-максимум: вывести мышь вообще без генов =)
no subject
Date: 2006-05-16 08:13 pm (UTC)Насчёт "вообще без генов" - это по современным понятиям, конечно, невозможно - ибо именно в генах весь организм и записан. Но идея выращивания "минимального живого существа" уже относительно давно считается лакомым кусочком.
no subject
Date: 2006-05-16 09:49 pm (UTC)Очевидно, они должны были чем-то питаться...
Как программист скажу
Date: 2006-05-17 04:56 am (UTC)Другое дело, что обычно нет бюджета применять их в таких масштабах.
Re: Как программист скажу
Date: 2006-07-12 06:08 pm (UTC)Количество параллельно запущеных виртуалок доходило до 50 (эксперименты параллелились), "ферма" использовалась вполне гаражно-бюджетная, сроки сопоставимые с ручным хаком.
В результаты этого скрипта, по моим скромным подсчётам, играло три-пять тысяч юных любителей вареза.
Так што метод ковровой бомбардировки не то што актуален -- он, тляха-муха, экономически актуален!
no subject
Date: 2006-05-19 04:50 pm (UTC)Или какой-нить такой метки, передающейся от молекулы к молекуле просто после реакции, и так по всей цепочке.......Меченый квант тепла, скажем....:)
Можно, конечно, тот же мышиный проект из соображений гуманности запустить на клеточных культурах, но как мне кажется, дороже культивировать клетки во флаконах, чем растить мышей.
Тока что отпостил в science.health.ageing.antiageing-list@subscribe.ru
Date: 2006-08-29 08:54 am (UTC)процессов там тысячи и время очень короткое - знают лишь основное,
и лищь косвенно могут догадываться о процессах, кроме того если
вы взглянете на любое современное представление клетки, например
методами системной биологии, то "понять" (качественно) это дерево
с тысями узлов невозможно. А если вы видели динамику этой "новогодней
елки" - то ничего и говорить не надо. Возможно его удасться "вычислить"
(количественно) - но это тоже не скоро, и не все понимают
необходимость, тк думают что что-то "понимают" и так, "качественно".
Но _отдельные_ (случайные) открытия всегда бывают. Почитайте например
статью "МОЖЕТ ЛИ БИОЛОГ ПОЧИНИТЬ РАДИОПРИЕМНИК, ИЛИ ЧТО Я ПОНЯЛ
ИЗУЧАЯ АПОПТОЗ". Весьма показательно. Кроме того могу сказать что
немногим современным ученым нужно содавать общую картину -
большинству достаточно копаться на своих "4-х сотках науки" и собирать
урожай, достаточный, чтобы прокормил. Да соседей отгонять =). Слишком много
нужно объединять, чтобы работать с современными объемами научных данных.
К 1 "ученому" нужно пристраивать лингвистов, инженеров по знаниям, математиков,
программистов ... чтобы те помогли ему строить плавсредства для
информационного потопа.
Куплю Windows
Date: 2006-12-05 07:34 am (UTC)и другой ЛИЦЕНЗИОННЫЙ софт
предложения на е-мейл telefon83@mail.ru
Куплю Windows
Куплю Windows, Office, Server и другое ЛИЦЕНЗИОННОЕ ПО Microsoft
предложения на е-мейл telefon83@mail.ru
Куплю по ВЫСОКИМ ЦЕНАМ, лицензионные Win98SE ME 2000 XP 2003, Office 2000 XP 2003 server 2000 2003 -, Куплю по высоким ценам, лицензионные Win98SE ME 2000 XP 2003, Office 2000 XP 2003 server 2000 2003 -, Куплю по ВЫСОКИМ ЦЕНАМ, лицензионные Win98SE ME 2000 XP 2003, Office 2000 XP 2003 server 2000 2003, Куплю по высоким ценам, лицензионные Win98SE ME 2000 XP 2003, Office 2000 XP 2003 server 2000 2003, Куплю лицензионные Win98SE 2000 XP 2003, Office 2000 XP 2003 server 2000 2003 -OEM BOX, Куплю лицензионные Win98SE 2000 XP 2003, Office 2000 XP 2003 server 2000 2003, Куплю по ВЫСОКИМ ЦЕНАМ, лицензионное П. О., Куплю лицензионные Win XP/2000, Office-2000/XP/2003 servera- 2003/2000 -RUS ENGL в комплекте и по от, Куплю лицензионные Win XP 2000 98 ME NT 95, Office-2000 XP server NT 2000 2003 -OEM BOX в комплекте, Куплю лицензионные Win XP/2000/98, Office-2000/XP/2003
Можно вскрытые, недокомплект, по частям (диски, книжки,наклейки).