dsRNA interference
Sep. 30th, 2004 09:28 am![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
jayrandomОказывается, существует такой любопытный эффект: подавление транскрипции определённых генов с помощью введения в клетку двусторонней РНК этого гена. У него два характерных свойства, которые можно использовать:
(1) подавление не передаётся по наследству, однако
(2) введённая двусторонняя РНК свободно мигрирует в пределах организма.
Даже не умея объяснить причины этого эффекта, его можно с огромной пользой употребить в исследованиях.
Интересно было бы понять и причины. Кажется вполне естественным, что повышение концентрации РНК обладает свойствами отрицательной обратной связи - чтобы лишние копии не мешались под ногами в процессе синтеза. Но односторонние РНК быстро поедаются нуклеазами, кроме того, они закручиваются в смешные загогулины (![[livejournal.com profile]](https://www.dreamwidth.org/img/external/lj-userinfo.gif)
liin знает об этом всё :) ). А двусторонняя, по-видимому, плавает, подавляя малейшие попытки. Но раз она продолжает функционировать и в таком виде, значит, механизм подавления - это не комплиментарное слипание, а что-то иное...
(1) подавление не передаётся по наследству, однако
(2) введённая двусторонняя РНК свободно мигрирует в пределах организма.
Даже не умея объяснить причины этого эффекта, его можно с огромной пользой употребить в исследованиях.
Интересно было бы понять и причины. Кажется вполне естественным, что повышение концентрации РНК обладает свойствами отрицательной обратной связи - чтобы лишние копии не мешались под ногами в процессе синтеза. Но односторонние РНК быстро поедаются нуклеазами, кроме того, они закручиваются в смешные загогулины (
liin знает об этом всё :) ). А двусторонняя, по-видимому, плавает, подавляя малейшие попытки. Но раз она продолжает функционировать и в таком виде, значит, механизм подавления - это не комплиментарное слипание, а что-то иное...
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2004-09-30 03:14 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:20 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:22 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:26 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:28 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:33 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:34 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:44 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:47 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 03:55 am (UTC)Over the next few years the mechanism underlying RNA interference was established from work on diverse organisms, especially the worm and the fruit fly. RNA interference was considered to be an evolutionarily ancient mechanism for protecting organisms from viruses. Many viruses have RNA, rather than DNA, as their genetic material and go through at least one stage in their life cycle in which they make double stranded RNA. All multicellular organisms possess a conserved protein machinery that recognises double stranded RNA.
Халявное ревью 2004 года, с красивыми схемами. http://bmj.bmjjournals.com/cgi/content/full/328/7450/1245
no subject
Date: 2004-09-30 04:10 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 04:14 am (UTC)no subject
Date: 2004-09-30 08:23 am (UTC)А функции разные.
В млекопитающих защита от РНК-вирусов.
В растениях и червяках - регуляция каких-то более сложных процессов в развитии.
На эту тему написано море обзоров за последние 5 лет. Например, в журнале Nature не далее как месяц назад было сразу несколько обзорных статей.
no subject
Date: 2004-10-01 05:50 am (UTC)Прости за серость...
Date: 2004-10-01 08:29 am (UTC)Если хитроспециальную РНК запустить в организму, то она будет блокировать выработку "её" белка, при этом сама не расходуясь и не портя изначальный код на ДНК. Причем, эта РНК может свободно мигрировать по организму.
?
Re: Прости за серость...
Date: 2004-10-01 10:25 am (UTC)Поскольку (тому нашлись подтверждения) это старинный механизм борьбы с ретровирусами (которые доставляются в клетку в виде самокомплиментарной РНК), то клетка относится к этому материалу крайне подозрительно. Обнаружив во своих стенах сдвоенную РНК, она режет её на кусочки по 20-23 буквы каждый, и потом прямым паттерн-матчингом ищет все одноцепочные РНК, которые на неё подозрительно похожи. Найдя, уничтожает нафиг. Таким образом, ДНК действительно, не страдает, но получить из этой штуки витальный белок становится проблематичным.
Однако есть подозрение, что этот эффект постепенно рассеивается. Особенно в растущем организме - ведь клеток всё больше, а изначального материала как максимум - константное количество, но скорее всего оно тоже падает.
no subject
Date: 2004-10-01 10:26 am (UTC)no subject
Date: 2004-10-01 10:28 am (UTC)Re: Прости за серость...
Date: 2005-02-01 05:22 am (UTC)no subject
Date: 2005-02-01 10:04 am (UTC)