dsRNA interference

[jayrandom]

Оказывается, существует такой любопытный эффект: подавление транскрипции определённых генов с помощью введения в клетку двусторонней РНК этого гена. У него два характерных свойства, которые можно использовать:
(1) подавление не передаётся по наследству, однако
(2) введённая двусторонняя РНК свободно мигрирует в пределах организма.

Даже не умея объяснить причины этого эффекта, его можно с огромной пользой употребить в исследованиях.

Интересно было бы понять и причины. Кажется вполне естественным, что повышение концентрации РНК обладает свойствами отрицательной обратной связи - чтобы лишние копии не мешались под ногами в процессе синтеза. Но односторонние РНК быстро поедаются нуклеазами, кроме того, они закручиваются в смешные загогулины (liin знает об этом всё :) ). А двусторонняя, по-видимому, плавает, подавляя малейшие попытки. Но раз она продолжает функционировать и в таком виде, значит, механизм подавления - это не комплиментарное слипание, а что-то иное...

Comments

[http://users.livejournal.com/_tori_/]

Присоединяюсь к предыдущему оратору. Механизм достаточно изучен, но Вас теория интересует или практика? Если второе, то в последние годы только ленивый этого не делал. Я, в частности, построила антисенс-констракт, самый простой вариант (трансформацию напарник делает). Вроде получается.

[ruslanka.livejournal.com]

Что трансформируем? Говорят, что в растениях через пару поколений сайленсинг наблюдается. То есть эффект от репрессии больше, чем обычными антисенсами, но устойчивость в поколениях странно выглядит.

[http://users.livejournal.com/_tori_/]

Я слышала, что в растениях все не так просто, но я от растений далека. Трансформируем мы гриб (не Нейроспора:)). А Вы с чем работаете, если не секрет?

[ruslanka.livejournal.com]

С горохом. Вернее с регуляцией развития его семени на уровне транскриптов.

[jayrandom.livejournal.com]

Больше механизм, конечно. И его естественная функция в организме, если таковая была :)

[http://users.livejournal.com/_tori_/]

Защита от вирусов:))

[jayrandom.livejournal.com]

Интересно. А это как-то было показано тоже (что вирус сайленсится тем же механизмом), или это гипотеза?

[http://users.livejournal.com/_tori_/]

Как-то у меня этот момент упустился. Действительно, интересно.

[http://users.livejournal.com/_tori_/]

An ancient antiviral mechanism.

Over the next few years the mechanism underlying RNA interference was established from work on diverse organisms, especially the worm and the fruit fly. RNA interference was considered to be an evolutionarily ancient mechanism for protecting organisms from viruses. Many viruses have RNA, rather than DNA, as their genetic material and go through at least one stage in their life cycle in which they make double stranded RNA. All multicellular organisms possess a conserved protein machinery that recognises double stranded RNA.

Халявное ревью 2004 года, с красивыми схемами. http://bmj.bmjjournals.com/cgi/content/full/328/7450/1245

[jayrandom.livejournal.com]

Здорово, спасибо. А то к нам завтра приезжает товарищ Tony Hyman из МаксПланка, будет про этот самый РНК-сайленсинг рассказывать, а я серый, как штаны пожарника. Будем встречать во всеоружии и задавать правильные вопросы :)

[murrka.livejournal.com]

По поводу вирусов и РНК можете еще про PKR покопать. Но к RNA-silensing он не имеет никакого отношения, точнее отношение совсем другое :)

[jayrandom.livejournal.com]

Спасибо. Тогда не будем распыляться. Нам же ещё мир спасать... :)