jayrandom: (Default)
[personal profile] jayrandom
Это не только для "танкистов", но и для всех людей доброй воли, кому интересно, какими методами иногда делается наука. Манипуляция и обман. Переписка с Александром Юрьевичем Кушелевым. Лучше сначала посмотреть мои предыдущие постинги на эту тему: самый первый и самый второй.

красота :)

Date: 2003-11-20 06:29 pm (UTC)
From: [identity profile] jayrandom.livejournal.com
Прочитал, но пока мало понял. Главное, чего не вижу - это соответствующих структур в базе. Получается, что либо эксперимент не довели до конца, либо целью не была структура (а только, может, какие-то детали типа этих самых углов гидроксильных групп).

Кстати, в качестве разрешающей способности там снова стоят числа порядка 1-2 ангстрёмов. Многовато будет, типа. Или нет?

В базе структур существует всего одна структура, определенная методом нейтронной дифракции (будем разбираться), плюс 6 структур методом электронной крио-микроскопии (мужики на морозе в ватниках и полушубках смотрят в микроскоп?), 1 структура методом 3-мерной электронной томографии и еще пару десятков EPR spectroscopy. Все остальное - старый добрый ЯМР и рентген.

Похоже, пока концептуально новой датой в промышленных масштабах еще не пахнет. Да, кстати, ты обратил внимание, что в статье, что ты послал, кристалл получали примерно год?

Все эти ребята бы Кушелева на сувениры растаскали, ежели бы его "наколенные" алгоритмы работали...

Re: красота :)

Date: 2003-11-21 03:12 am (UTC)
From: [identity profile] b-my.livejournal.com
Я так понял, что стуктура именно этого триптоцина НСА уже хорошо изучена и всем известна, именно поэтому они и взялись за тонкие эффекты навроде положения этих гидроксильных групп.

Многовато? Ну, наверное... меньше было бы лучше.
Тут соль не в том, что нейтроны очень точные вообще (хотя в потенциале это, наверное, так), а в том, что они видят водород, о котором на рентгене ты только гадаешь, и для них высококонтрастны элементы с близкими номерами. Например, азот и кислород.
Во-первых, это должно резко сужать поле интерпретаций дифракционной картинки. А во вторых, ну представь - так ты только предполагаешь, что где-то тут должен быть водород, из расчетов, а так ты видишь что водород - вот тут. То есть резко сужается возможность "полной ошибки", когда у тебя не "вот этот водород на треть ангстрема вверх и влево", а "вообще вот этого здесь нету, а вот тут оно на самом деле". Для предсказания фолдинга, я так понимаю, первый тип ошибок не столь критичен как второй.

Для промышленного масштаба даты нужна эта самая "промышленность". А стоимость установок для НД велика, установок мало. Для того чтобы сделать рентген нужна рентгеновская трубка. А для того чтобы сделать нейтроны, нужен ядерный реактор с хорошей мощностью, нейтронными отводами, монохроматором и еще кучей всякого железа, которое потом станет радиоактивным... но полезность метода сейчас крепко осознали.
Но я к чему? К тому, что если кто-то, в порядке исключения, получил такую дату для избранных белков, то это грех не использовать. Хотя бы в таких вот случаях. :)

О, это всяко. :)

Будем искать...

Date: 2003-11-23 09:19 pm (UTC)
From: [identity profile] jayrandom.livejournal.com
... или ждать, пока эта дата станет доступной.

Хотел бы я увидеть картинки с РСА и пронаблюдать процесс интерпретации оных, чтобы своими органами чувств, так сказать, познать все прелести.

Re: Будем искать...

Date: 2003-11-24 02:07 am (UTC)
From: [identity profile] b-my.livejournal.com
О, у нас этого гуталину... :)
Правда, у меня неорганика и вообще все простенькое (относительно белков). Но, если хочешь - накину.

конечно, хочу!

Date: 2003-11-24 05:22 pm (UTC)
From: [identity profile] jayrandom.livejournal.com
Давай, кидай, очень интересно. Желательно в общедоступном формате. Самый супер - это если еще и с комментариями "посмотрите налево, посмотрите направо". Для ламеров.

Кстати, почему бы не запостить такой постинг в свой журнал? Думаю, не мне одному интересно.

Re: конечно, хочу!

Date: 2003-11-27 05:41 am (UTC)
From: [identity profile] b-my.livejournal.com
Это потребует некоторого времени - комментарии, я имею в виду, а не пост файла с датой.

Если честно, не думаю, что еще кому-то может быть интересна интересна сырая дата с рентгенодифрактометра. :)
Даже с комментариями. :)

будет-будет!

Date: 2003-11-27 09:59 am (UTC)
From: [identity profile] jayrandom.livejournal.com
Обязательно будет. Мне интересно, а потом будет интересно тем, с кем я общаюсь. Значительно проще дать линк на ЖЖ-постинг, чем рыться по почте в поисках. Да и нагляднее все на одной страничке.

А тебе, надеюсь, один пень, куда выкладывать (если уж соберешься) :)

Profile

jayrandom: (Default)
jayrandom

January 2026

S M T W T F S
    1 23
45678910
111213141516 17
18192021222324
25262728293031

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 19th, 2026 05:03 pm
Powered by Dreamwidth Studios