Наномир. Дорогая редакция...
Oct. 20th, 2003 12:15 amВот это да... если это все правда, то какая огромная тусовка непонятно чем занимается!
Кратко, основная идея: 61 кодон для 20 аминокислот существуют не просто ради избыточности. Эта-то избыточность и определяет пространственную структуру получающегося белка!
Для пехотинцев: классически, в биоинформатике считается, что РНК-аминокислотный код - избыточный (от 1 до 6 разных триплетов кодирует одну аминокислоту). Алгоритмически странслировав триплеты в аминокислоты, нам говорят: "все, мы сэмулировали процесс, происходящий в природе при трансляции. Вот вам цепочка аминокислот. Теперь эта хрень примет 3-мерную форму, которая однозначно определяется химической структурой."
А вот и хрен, неоднозначно. Потому-то предсказание трехмерной структуры белка и оказывается такой сложной и почти неразрешимой задачей. "Ищут пожарные, ищет милиция..." Эх, напьюсь :)
Вообще, конечно, хроники лаборатории "Наномир" впечатляют безмерно. И с юмором - внимание на фотки примерно в середине этой статьи - с ребенком :) Разумеется, статью тоже стоит прочитать.
Кратко, основная идея: 61 кодон для 20 аминокислот существуют не просто ради избыточности. Эта-то избыточность и определяет пространственную структуру получающегося белка!
Для пехотинцев: классически, в биоинформатике считается, что РНК-аминокислотный код - избыточный (от 1 до 6 разных триплетов кодирует одну аминокислоту). Алгоритмически странслировав триплеты в аминокислоты, нам говорят: "все, мы сэмулировали процесс, происходящий в природе при трансляции. Вот вам цепочка аминокислот. Теперь эта хрень примет 3-мерную форму, которая однозначно определяется химической структурой."
А вот и хрен, неоднозначно. Потому-то предсказание трехмерной структуры белка и оказывается такой сложной и почти неразрешимой задачей. "Ищут пожарные, ищет милиция..." Эх, напьюсь :)
Вообще, конечно, хроники лаборатории "Наномир" впечатляют безмерно. И с юмором - внимание на фотки примерно в середине этой статьи - с ребенком :) Разумеется, статью тоже стоит прочитать.
зажрались! :)
Date: 2003-12-12 10:10 pm (UTC)А насчет "зажрались" - мне кажется, что это не совсем так. Просто при меньшем разрешении этот инструмент едва ли представляет интерес для молбиологов вааще. Ну на что там смотреть? На общую форму, принимаемую ДНКой? Ну, перепутанная нитка - она и в Африке такая. А вот когда до зарезу надо посмотреть, как именно атомы развешаны... впрочем, 3А это дает еще не очень хорошо :)
Тут уместна аналогия профессионального пленочного фотографа в эру цифровиков. Если уж ему переходить на цифру, то именно на стандарты, которые юзеры рядовых мыльниц будут считать "зажирательством". А ему иначе-то и резону нет... Что он выжмет из 480 килопикселей? :)