Если на белок посветить УФ, он будет светиться, причем сила его свечения будет зависеть от длины волны. Светятся там три аминокислоты - "aromatic phenylalanine, tyrosine and tryptophane", которые содержат ароматические кольца. Разумеется, способность белка светиться зависит от фолдинга, потому как на кольца влияет их окружение, а окружение в свернутом виде совсем иное.
Далее начинаются чудеса. Белок сфолжен только в определенном интервале температур, ниже и выше он расфолжен, так что если белок заморозить, а затем начать греть, то можно засечь момент, когда он завернется в правильную форму, более того - наблюдать за процессом свертки, ведь время этого заворота достаточно велико. Порядка микросекунд.
То есть белок морозим - он раскладывается. Затем начинаем греть ИК-лазером. Все это время делаем "вцик!-вцик!-вцик!" импульсным УФ-лазером, на что наши три аминокислоты откликаются светом (время отклика, за которое аминокислота высветит свое в ответ, очень мало, для трифторана - порядка 14нс). Отклик аккуратно записываем.
В результате имеем картинку во времени "как изменялось окружение ароматических колец за время фолдинга". Разумеется, по этой картинке однозначно сказать, мимо кого эти кольца пролетали, нельзя. Но можно сравнить эту картинку с нашей компутерной симуляцией и сделать выводы, насколько она соответствует реальности... что, я так понимаю, вам тоже ценно.
![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
timeasmymeasure
Кстати.
Date: 2003-11-11 09:16 pm (UTC)Далее начинаются чудеса. Белок сфолжен только в определенном интервале температур, ниже и выше он расфолжен, так что если белок заморозить, а затем начать греть, то можно засечь момент, когда он завернется в правильную форму, более того - наблюдать за процессом свертки, ведь время этого заворота достаточно велико. Порядка микросекунд.
То есть белок морозим - он раскладывается. Затем начинаем греть ИК-лазером. Все это время делаем "вцик!-вцик!-вцик!" импульсным УФ-лазером, на что наши три аминокислоты откликаются светом (время отклика, за которое аминокислота высветит свое в ответ, очень мало, для трифторана - порядка 14нс). Отклик аккуратно записываем.
В результате имеем картинку во времени "как изменялось окружение ароматических колец за время фолдинга". Разумеется, по этой картинке однозначно сказать, мимо кого эти кольца пролетали, нельзя. Но можно сравнить эту картинку с нашей компутерной симуляцией и сделать выводы, насколько она соответствует реальности... что, я так понимаю, вам тоже ценно.