Носил статью одному из шефов, который шарит. Он посмеялся, и сказал, что уже встречал нескольких подобных сумасшедших, но что все на самом деле должна показывать практика. Чтоб я проверил на досуге (прогнал демку) на нетривиальных белках (глобины ему не нравятся - "слишком просто", а киназы почему-то нравятся больше) и сравнил с результатами рентгеноструктурного анализа.
Как биологу я ему верю, но как физику скорее поверю тебе. Скажи - рентген в вопросах определения 3-мерной конфигурации кристалла рулит или сосет? Кушелев утверждает, что у него разрешающая способность около 1 ангстрёма, но т.к. это во всех направлениях, то слишком уж кисло. Спецы говорят, что ЯМР обладает разрешением ХУЖЕ чем рентген. Вот и вопрос - а есть ли у нас что-нибудь незыбкое, с чем сравнивать?
Кроме того, оказывается, есть специальные белки, которые помогают сложить белок в сложных случаях. (Например, когда белок торчит одним концом через клеточную мембрану и ему тяжело по ту сторону крутиться.) Т.е. от процесса трансляции тут мало чего зависит - все равно "применят патч". Следовательно, если метод Кушелева работает, то не как панацея, а как одна из фаз предсказания 3-мерной структуры.
Но я буду посмотреть, обязательно. Почему-то я настроен очень романтически. Хочется верить, что есть где-то самородки, которые с помощью тонны колечек от занавесок могут объяснить тайну молекулярных взаимодействий безо всяких квантОв. Возможно, это просто от лени разбираться с квантАми :)
![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
timeasmymeasure
вдохнул...
Date: 2003-10-21 12:19 pm (UTC)Как биологу я ему верю, но как физику скорее поверю тебе. Скажи - рентген в вопросах определения 3-мерной конфигурации кристалла рулит или сосет? Кушелев утверждает, что у него разрешающая способность около 1 ангстрёма, но т.к. это во всех направлениях, то слишком уж кисло. Спецы говорят, что ЯМР обладает разрешением ХУЖЕ чем рентген. Вот и вопрос - а есть ли у нас что-нибудь незыбкое, с чем сравнивать?
Кроме того, оказывается, есть специальные белки, которые помогают сложить белок в сложных случаях. (Например, когда белок торчит одним концом через клеточную мембрану и ему тяжело по ту сторону крутиться.) Т.е. от процесса трансляции тут мало чего зависит - все равно "применят патч". Следовательно, если метод Кушелева работает, то не как панацея, а как одна из фаз предсказания 3-мерной структуры.
Но я буду посмотреть, обязательно. Почему-то я настроен очень романтически. Хочется верить, что есть где-то самородки, которые с помощью тонны колечек от занавесок могут объяснить тайну молекулярных взаимодействий безо всяких квантОв. Возможно, это просто от лени разбираться с квантАми :)