Наномир. Дорогая редакция...

[jayrandom]

Вот это да... если это все правда, то какая огромная тусовка непонятно чем занимается!

Кратко, основная идея: 61 кодон для 20 аминокислот существуют не просто ради избыточности. Эта-то избыточность и определяет пространственную структуру получающегося белка!

Для пехотинцев: классически, в биоинформатике считается, что РНК-аминокислотный код - избыточный (от 1 до 6 разных триплетов кодирует одну аминокислоту). Алгоритмически странслировав триплеты в аминокислоты, нам говорят: "все, мы сэмулировали процесс, происходящий в природе при трансляции. Вот вам цепочка аминокислот. Теперь эта хрень примет 3-мерную форму, которая однозначно определяется химической структурой."

А вот и хрен, неоднозначно. Потому-то предсказание трехмерной структуры белка и оказывается такой сложной и почти неразрешимой задачей. "Ищут пожарные, ищет милиция..." Эх, напьюсь :)

Вообще, конечно, хроники лаборатории "Наномир" впечатляют безмерно. И с юмором - внимание на фотки примерно в середине этой статьи - с ребенком :) Разумеется, статью тоже стоит прочитать.

Comments

аквапорин? (слышал звон...)

[jayrandom.livejournal.com]

Аквапорин - это тот самый, который трансмембранный переносчик воды?

Откуда-то помню, что один чувак пытался доказать, что вода сама по себе через мембрану не проходит, что для этого нужны механизмы. И вплел какой-то подозреваемый на эту функцию белок в мембрану куриного яйца. Публично опустил яйцо в воду и его разорвало в клочья засосанной водой.

Это случайно не про аквапорин анекдот?

Re: аквапорин? (слышал звон...)

[kostia-inochkin.livejournal.com]

не знаю:0 может, и про_него. Но вода, говорят, диффузией в клетку залезает.
Однако аквапорины нонче в моде. У нас даже был один мутант по такому каналу, мучили его осмотическими стрессами, думали сжиматься и разжиматься будет хуже. Ничего, как помню, не вышло:)

Re: аквапорин?

[jayrandom.livejournal.com]

Не, точно не диффузией. На то и эксперимент был. Другое дело, что я не уверен, что это тот самый белок. Но история хорошо запомнилась :)

Какая страшная история...

[b-my.livejournal.com]

Но разве ета... скорлупа - она живая?

Re: Какая страшная история...

[jayrandom.livejournal.com]

Нет, скорлупа не живее зуба. Даже ещё меньше, ибо в ней нервов нема. Но под скорлупой находится одна большая клетка с желтым ядром, полным вкусной ДНК :)

А у клетки под скорлупой есть белковая мембрана, как и у любой другой. И она этой мембраной дышит, нюхает, и еще Бог знает, как со своей средой взаимно обменивается. Оказалось, что если в мембрану при ее построении встроить насос, то он и через известняковый слой неплохо воду тянет :)